超聲波清洗機在清洗過程當中經常會使用清洗劑，清洗劑及加熱溫度在超聲波清洗過程中通常會影響到清洗的速度，同時大多數清洗液中的化學成分都會在一定溫度下達到最佳清潔效果，找到最佳溫度的最好方法就是實驗。通常，最佳清洗溫度會在50℃到65℃之間。不要使用易燃的或低閃點溶液�？栈�作用釋放出的能量被轉化成熱能和動能并在溶液內產生高溫，這對于易燃液體是非常危險的。酸性清洗液、漂白劑通常情況下應當避免使用，因為它們會損壞不銹鋼槽或產生危害；但當它們用于間接清洗工藝中，如用大口燒杯作為間接清洗容器時可以使用。